FJA hỗ trợ thủ tục gia hạn visa hay thay đổi tư cách lưu trú tại Cục quản lý xuất nhập cảnh. Cán bộ trường sẽ hỗ trợ học viên những thủ tục hành chính phức tạp. Trong nhiều năm qua, tỉ lệ đỗ tư cách lưu trú (COE) tại Nhật của học viên FJA đều trên 95%.